湖南省土家医药研究中心是在原国家中药现代化工程技术研究中心“土家医药研究分中心”基础上组建。牵头建设单位为吉首大学，共建单位为湘西土家族苗族自治州民族中医院和湘西土家族苗族自治州民族医药研究所，参建单位包括湖南中医药大学、湖南省中医药研究院、湖南医药学院。研究中心下设4个研究室，分别为土家医药资源信息研究室、土家医临床应用研究室、土家药有效成分与药理研究室、土家药食制品研究室。目前研究中心有专职和兼职成员40余人，其中，正高级职称18人、副高级职称16人，硕士以上学历者占65%；有湖南省“芙蓉学者”专家1人、湖南省“121”人才工程人选4人、湖南省优秀中青年专家3人。
研究中心各成员前期一直围绕民族医药开展科学研究与临床应用。近五年共承担了国家级、部省级项目以及横向课题50余项；发表了学术论文100余篇，其中SCI收录37篇；申请获得专利20余项；出版民族医药专著20余部，完成6项土家医/苗医诊疗技术的制修订和推广应用。研究成果先后获湖南省自然科学二等奖1项、三等奖2项，获湖南省科技进步三等奖3项，其它奖励20余项。
目前，研究中心正开展传统土家医药古籍文献和临床经验、秘验方、医技的收集和整理，建立土家医药知识信息化数据库；开展特色土家医诊疗技术标准（土家医麝针疗法、土家医推油火疗法、土家医烧艾疗法、土家医放痧疗法、土家医扯罐疗法等）的制修订、培训和临床推广应用；开展土家药用植物白头婆、牛王刺和抱石莲等活性化合物的分离、制备及药理药效研究；开展治疗骨质疏松和关节炎等病的功能性保健品研发以及抗艾滋病土家药的研发等。
